Alors que Rin s'est absentée, Shirou est appelé par Shinji, qui a quelque chose d'important. Ce dernier se rue à l'école et tombe dans le piège de son camarade : le kekkai activé, tous les élèves ont sombré dans le coma et Shinji est près à être tué par Rider. Ne voyant plus d'autre solution, le jeune homme invoque Saber...